В 2006 году Межрайонная инспекция Федеральной налоговой службы N 2 по Омской области, имеющая прописку в городе Таре, провела выездную налоговую проверку ООО «Варм» по вопросам правильности исчисления, удержания и перечисления налога на прибыль, налога на добавленную стоимость, налога на доходы физических лиц, транспортного налога за период с 1 января 2004 года по 31 декабря 2005 года.
По результатам проверки налоговым органом был составлен акт от 16 июня 2006 года №12-06/1279 и принято решение №12-06/1361 от 30 июня того же года о привлечении организации к налоговой ответственности по пункту 1 статьи 122 НК РФ в виде штрафов в сумме 331 202 рублей за неполную уплату налога на добавленную стоимость за 2004-2005 годы, а также в размере 451 628 рублей за неполную уплату налога на прибыль.
В итоге ООО «Варм» доначислили 1 656 млн рублей за НДС и 2 258 млн рублей за налог на прибыль. Всего получилось около 4, 7 млн рублей.
Решение Межрайонной инспекции Федеральной налоговой службы N 2 по Омской области в ноябре 2006 года было оспорено предприятием в Арбитражном суде Омской области. Апелляционная инстанция и Федеральный арбитражный суд Западно-Сибирского округа оставили его также без изменения.
Несмотря на это, 25 июня 2007 года УФНС по Омской области приняло решение № 03-1916/12826 о проведении повторной выездной проверки ООО «Варм». Ссылаясь на статью 89 НК РФ, вышестоящий налоговый орган захотел проконтролировать деятельность Межрайонной инспекции Федеральной налоговой службы N 2 по Омской области.
Полагая, что при наличии судебных актов по результатам первой проверки у налогового органа отсутствовали основания для проведения повторной ревизии, налогоплательщик вновь обратиться в арбитражный суд. На этот раз суд был на стороне УФНС по Омской области. Не изменил решение и Восьмой арбитражный апелляционный суд.
А в марте текущего года вышло постановление Федерального арбитражного суда Западно-Сибирского округа, который оставил решение двух инстанций без изменения.
Окружной суд установил, что проведение повторной налоговой проверки было назначено непосредственно в порядке контроля Управления за деятельностью Межрайонной инспекции Федеральной налоговой службы N 2 по Омской области, соответствующего требованиям ч. 10 ст. 89 НК РФ.
В компании «Варм» напрочь отказались комментировать сложившуюся ситуацию, заявив лишь, что «уверены в положительном решении Конституционного суда».
В УФНС по Омской области не стали делать прогнозы, чем закончится разбирательство в суде. Однако сообщили, что повторная проверка ООО «Варм» была произведена в рамках закона.